Dopo un concerto di beneficenza alquanto movimentato i Chipmunks, Alvin, Simon e Theodore, perdono il l0ro amico e manager Dave Seville (Jason lee) che infortunatosi e bloccato in un letto d’ospedale si vede costretto ad affidare i tre amici alla zia Jackie. Salutato l’amico e raggiunta la zia, in aereoporto altro giro altro guaio, la zia su una sedia a rotelle accidentalmente si fa un’intera rampa di scale così ricoverata anche lei, la responsabilità del terzetto di scoiattoli canterini ricadrà tutto sul ben poco sveglio nipote Toby (Zachary Levi)

Oltre alla convivenza con l’imabranatissimo Toby, i tre  si troveranno a dover frequentare un liceo, dove diventeranno il bersaglio dell’intera squadra di football infastidita della popolarità dei tre roditori tra le ragazze, ad accontentare una preside fan sfegatata che gli chiederà di partecipare ad una competizione musicale tra licei con un ghiotto premio di 25.000 dollari, e tanto per non farsi mancare nulla ecco spuntare un trio di talentuose scoiattoline, cloni in gonnella di Alvin e compagni, scovate fortuitamente dal loro ex-manager, l’avido e mellifluo Ian Hawk (David Cross), che sfrutterà le tre chipmunks in gonnella per risalire la china.

Naturalmente in principio le due formazioni, i Chipmunks e le Chipettes saranno in competizione, ma come in ogni favola con lieto fine che si rispetti la natura e gli eventi faranno il loro corso, e i sei scoiattolini diventeranno un’unica e travolgente band scalaclassifiche.

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